Symtomen vid celiaki, eller glutenintolerans som det ibland kallas, varierar mellan olika personer. Vissa mår väldigt dåligt, medan andra endast får vaga symtom av att äta gluten. Det finns också de som inte alls märker av sin celiaki.

Hos små barn är de vanligaste symtomen att de växer sämre än andra barn. Andra vanliga tecken på celiaki hos barn är magont, dålig aptit, järn- och vitaminbrist, illamående med kräkningar och diarré och/eller förstoppning.

Att ungdomar kommer in sent i puberteten, och senare i livet får svårt att få barn, kan också bero på oupptäckt celiaki. Obehandlad celiaki kan även vara orsaken till att man som vuxen lättare bryter ben i kroppen (på grund av dåligt upptag av kalk i tarmen som ger benskörhet), får värk i kroppen eller blåsor i munnen och på huden.

Hos vuxna kan symtomen också vara mer diffusa än hos barn; trötthet, viktminskning och depressioner kan vara symtom av celiaki. Magbesvär är vanliga hos vuxna som har celiaki, men liksom hos barn varierar symtomen från person till person. Vissa får diarré, förstoppning eller gasspänningar, medan andra saknar tydliga symtom.

Obehandlad celiaki kan ge järnbrist och vitaminbrist hos både barn och vuxna. Detta hänger samman med att tarmen inte kan ta upp näringsämnen lika effektivt när tarmluddet är skadat eller helt borta.

Även laktosintolerans är relativt vanligt vid obehandlad celiaki. Det beror på att tarmens möjlighet att bryta ner laktos (mjölksocker) minskar till följd av att det finns mindre av enzymet laktas i tarmen när tarmluddet är skadat. Laktosintolerans som orsakats av celiaki går dock ofta över när tarmluddet återhämtat sig då man börjat äta glutenfri kost.

Symtom på laktosintolerans kan vara magsmärtor, gasbildning, uppsvälld mage och diarré, det vill säga symtom som även kan förekomma vid obehandlad celiaki.